More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1557 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 467 aa  952    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  51.93 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  50.64 
 
 		 464 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  49.89 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  49.89 
 
 		 442 aa  438  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  50.43 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  49.25 
 
 		 458 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  50 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  47.76 
 
 		 727 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  47.12 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  44.23 
 
 		 445 aa  405  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  45.86 
 
 		 470 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  44.76 
 
 		 543 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 588 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 		 447 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 436 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 496 aa  246  6e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.75 
 
 		 506 aa  246  6e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 453 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  32.85 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.64 
 
 		 495 aa  234  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 609 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  44.84 
 
 		 472 aa  226  8e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 512 aa  223  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  32.27 
 
 		 530 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  31.08 
 
 		 569 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 487 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  30.74 
 
 		 561 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 489 aa  220  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  32.06 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.98 
 
 		 776 aa  216  5e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  30.39 
 
 		 491 aa  216  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 573 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 573 aa  210  4e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  33.12 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  33.83 
 
 		 474 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 578 aa  208  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  32.05 
 
 		 486 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  32.29 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 481 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  28.42 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  33.64 
 
 		 579 aa  184  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 581 aa  179  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 582 aa  179  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 		 513 aa  170  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.02 
 
 		 706 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 533 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  26.48 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.8 
 
 		 339 aa  87  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.72 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.28 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.56 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.26 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.96 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.93 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.45 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.56 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.39 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.24 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.18 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.6 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3349  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.81 
 
 		 346 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366452  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.24 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.8 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.72 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.28 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.93 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.57 
 
 		 337 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.92 
 
 		 344 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.92 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.79 
 
 		 333 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.29 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.07 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 		 333 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 337 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.11 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1230  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.39 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0359079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  32.9 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>