More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1809 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 578 aa  1205    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  91 
 
 		 579 aa  1092    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  91.15 
 
 		 573 aa  1115    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  68.63 
 
 		 569 aa  847    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  88.85 
 
 		 573 aa  1088    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  43.94 
 
 		 506 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  45.66 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  42.09 
 
 		 495 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  42.12 
 
 		 512 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  43.38 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 		 489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  42.5 
 
 		 496 aa  405  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  43.14 
 
 		 495 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 609 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  38.73 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  38.56 
 
 		 581 aa  371  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 513 aa  359  6e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  36.89 
 
 		 561 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  34.05 
 
 		 608 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 447 aa  240  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 471 aa  241  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  33.47 
 
 		 445 aa  240  5e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 458 aa  239  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  33.47 
 
 		 441 aa  236  8e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.66 
 
 		 471 aa  230  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  32.71 
 
 		 727 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 442 aa  219  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 		 470 aa  216  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  31.61 
 
 		 465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  38.65 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 530 aa  213  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  31.34 
 
 		 453 aa  211  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 467 aa  208  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 		 523 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  28.33 
 
 		 776 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.09 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 		 519 aa  200  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  28.73 
 
 		 706 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  35.52 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  27.79 
 
 		 486 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.89 
 
 		 455 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  27.18 
 
 		 479 aa  177  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  27.9 
 
 		 474 aa  173  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  29.01 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 481 aa  170  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 463 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  23.61 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 533 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1683  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.86 
 
 		 327 aa  80.1  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.21 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.37 
 
 		 336 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.9 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.32 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.79 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.29 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  27.27 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.26 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.26 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.46 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.49 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.08 
 
 		 329 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 329 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.42 
 
 		 333 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.29 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.29 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.29 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.98 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.07 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.29 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.23 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.13 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.56 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.62 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.73 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03862  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.64 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.04 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.13 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.7 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.29 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.13 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1648  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.53 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.918642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.65 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.491091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>