More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1818 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  100 
 
 
519 aa  1051    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  45.01 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  41.76 
 
 
459 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  42.13 
 
 
492 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
727 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.04 
 
 
464 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 
467 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  38.9 
 
 
445 aa  363  4e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  43.66 
 
 
458 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 
588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  42.28 
 
 
471 aa  362  9e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  42.44 
 
 
465 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  41.31 
 
 
471 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 
441 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 
470 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 
543 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  34.5 
 
 
447 aa  298  1e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  32.12 
 
 
506 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 
496 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 
472 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.79 
 
 
495 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
453 aa  223  7e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 
489 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  30.1 
 
 
495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  32.82 
 
 
776 aa  216  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 
436 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  30 
 
 
561 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  30.78 
 
 
530 aa  213  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 
487 aa  212  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  28.93 
 
 
491 aa  212  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
512 aa  210  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
441 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  30.59 
 
 
523 aa  206  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 
578 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 
569 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  32.42 
 
 
608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 
609 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 
579 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 
573 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  30.91 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  31.16 
 
 
474 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 
582 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  29.32 
 
 
479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 
573 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 
581 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 
481 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  29.47 
 
 
471 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  36.22 
 
 
486 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
513 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 
559 aa  155  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
514 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  30.57 
 
 
514 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
514 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 
533 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  31.31 
 
 
706 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.16 
 
 
347 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1985  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1959  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1937  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2133  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3175  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.61 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.3 
 
 
325 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1976  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.14 
 
 
337 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.79 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  35.67 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0355  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.09 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4416  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.98 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.41 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.59 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2166  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.54 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.92 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.7 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.46 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.79 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.41 
 
 
328 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1444  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.71 
 
 
380 aa  70.1  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000773011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.56 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2768  molybdopterin biosynthesis, protein A  31.55 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149516  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.15 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.49 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.22 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.83 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.82 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.56 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.56 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.89 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.31 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.386779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.83 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.3 
 
 
296 aa  67  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.72 
 
 
329 aa  67  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  0.0000106016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.44 
 
 
329 aa  67  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.63 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.53 
 
 
344 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.71 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0187  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.36 
 
 
330 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00819239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.72 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.71 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>