151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3844 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4236  radical SAM family protein  67.77 
 
 		 514 aa  700    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.767249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 533 aa  1092    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4322  radical SAM domain-containing protein  67.77 
 
 		 514 aa  700    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4615  radical SAM domain-containing protein  67.77 
 
 		 514 aa  700    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  33.11 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  31.2 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  35.33 
 
 		 479 aa  199  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  31.7 
 
 		 455 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1986  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 		 453 aa  193  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0301  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 481 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 530 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  29.69 
 
 		 486 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.18 
 
 		 776 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0823  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 463 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  31.09 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 727 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.36 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  29.28 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2362  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 512 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0843  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.996552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  24.25 
 
 		 495 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2775  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.29 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0603856  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  22.75 
 
 		 561 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 465 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 		 543 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1003  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00934778  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0580  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.720942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0319  hypothetical protein  23.43 
 
 		 491 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0183  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 608 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.531791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 		 496 aa  101  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  22.26 
 
 		 609 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  23.03 
 
 		 506 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 569 aa  98.6  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 573 aa  98.6  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1818  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 519 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630442  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  23.48 
 
 		 578 aa  96.7  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0637  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 588 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.179441 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1684  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.622804  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  23 
 
 		 573 aa  91.3  4e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0793  radical SAM family Fe-S protein  23.97 
 
 		 706 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768021  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0020  radical SAM domain-containing protein  21.84 
 
 		 581 aa  88.6  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00170872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1215  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 		 582 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0970517  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0115  radical SAM domain-containing protein  21.04 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000926294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 800 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.35 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 1000 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3487  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 316 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 366 aa  53.5  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.28 
 
 		 337 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.28 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0050  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.62 
 
 		 231 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5689  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 416 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 327 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 358 aa  51.6  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  29.08 
 
 		 367 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 1005 aa  50.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  27.73 
 
 		 300 aa  50.4  0.00007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 459 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 325 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  43.21 
 
 		 345 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.17 
 
 		 353 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 1039 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  35.9 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.06 
 
 		 316 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.16 
 
 		 326 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1899  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.67 
 
 		 234 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000119044  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2135  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.32 
 
 		 323 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.28 
 
 		 326 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.32 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.49 
 
 		 330 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263056  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 372 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.41 
 
 		 335 aa  47.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.61 
 
 		 335 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 319 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15625  predicted protein  30.17 
 
 		 335 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 482 aa  47.8  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.2 
 
 		 380 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.32 
 
 		 353 aa  47  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  36.23 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>