More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3391 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 800 aa  1623    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  46.59 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  47.58 
 
 		 385 aa  367  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  49.3 
 
 		 383 aa  363  6e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 		 389 aa  343  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  45.25 
 
 		 387 aa  342  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  46.2 
 
 		 388 aa  341  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  41.6 
 
 		 381 aa  306  7e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 444 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  25.39 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.38 
 
 		 398 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.87 
 
 		 438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.38 
 
 		 398 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.38 
 
 		 398 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.38 
 
 		 398 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  25.87 
 
 		 411 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  25.6 
 
 		 411 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25.6 
 
 		 411 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 435 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.1 
 
 		 398 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 411 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  25.33 
 
 		 411 aa  119  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 370 aa  119  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.73 
 
 		 431 aa  118  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 		 431 aa  118  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  24.35 
 
 		 435 aa  118  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 435 aa  118  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 405 aa  118  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  25.4 
 
 		 411 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  25.4 
 
 		 411 aa  117  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.73 
 
 		 431 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.73 
 
 		 431 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  25.4 
 
 		 411 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.45 
 
 		 447 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  21.79 
 
 		 370 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 391 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  27.58 
 
 		 367 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  25.14 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 369 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.4 
 
 		 391 aa  112  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.4 
 
 		 391 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 431 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.84 
 
 		 414 aa  110  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  24.8 
 
 		 408 aa  109  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 429 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  20.72 
 
 		 385 aa  107  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  20.44 
 
 		 385 aa  107  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  22.17 
 
 		 440 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  20.44 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  20.44 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  20.44 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  20.44 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  20.44 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  20.44 
 
 		 385 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 393 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  21.53 
 
 		 410 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  21.53 
 
 		 410 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 397 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 414 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 407 aa  103  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  26.72 
 
 		 365 aa  102  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 422 aa  101  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.19 
 
 		 395 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 		 516 aa  100  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  22.62 
 
 		 383 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.19 
 
 		 395 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 402 aa  99.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.19 
 
 		 396 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 381 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.92 
 
 		 396 aa  98.6  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 427 aa  97.8  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  21.49 
 
 		 368 aa  97.8  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  26.36 
 
 		 370 aa  97.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 462 aa  96.3  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  27.35 
 
 		 460 aa  95.9  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 470 aa  94.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.31 
 
 		 398 aa  94  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 		 1002 aa  92  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 366 aa  91.7  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 407 aa  91.3  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 		 365 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 428 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 471 aa  90.1  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  23.9 
 
 		 402 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 403 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 401 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.73 
 
 		 394 aa  87.8  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 461 aa  87.8  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 414 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 476 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.73 
 
 		 394 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  23.14 
 
 		 394 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  20.15 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 489 aa  86.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.73 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>