More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0580 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  813    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  72.49 
 
 
387 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  69.15 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  69.41 
 
 
385 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  63.9 
 
 
381 aa  542  1e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  65.01 
 
 
380 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  64.18 
 
 
383 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  45.17 
 
 
800 aa  333  3e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 
444 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 
367 aa  127  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 
405 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
370 aa  123  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  26.86 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  26.86 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 
411 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  26.33 
 
 
411 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  26.6 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  26.6 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 
411 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  26.6 
 
 
411 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.55 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.14 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 
435 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  25.63 
 
 
414 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  26.06 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 
435 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 
435 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.12 
 
 
431 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25.36 
 
 
431 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.88 
 
 
447 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  25.34 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  23.3 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 
369 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  25 
 
 
431 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 
410 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 
410 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.88 
 
 
431 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 
431 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 
414 aa  109  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 
368 aa  106  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
398 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 
397 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.1 
 
 
383 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.4 
 
 
398 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  23.51 
 
 
440 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  23.39 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  25.67 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  23.64 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  25.67 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 
393 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.41 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
407 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  22.37 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.67 
 
 
394 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.35 
 
 
394 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.93 
 
 
398 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.67 
 
 
394 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
447 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  22.85 
 
 
280 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  22.25 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.25 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
384 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.87 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.87 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.98 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.56 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  20.41 
 
 
374 aa  76.6  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.69 
 
 
373 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.2 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  29.94 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  24.3 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.88 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  24.34 
 
 
473 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>