More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4353 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.07 
 
 		 431 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.07 
 
 		 431 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  100 
 
 		 431 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  98.84 
 
 		 447 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.07 
 
 		 431 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.65 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.65 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.39 
 
 		 395 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.39 
 
 		 396 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  49.87 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  47.74 
 
 		 407 aa  408  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  46.71 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  47.72 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  47.84 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  47.97 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  47.84 
 
 		 411 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  48.09 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  47.21 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  47.97 
 
 		 411 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  47.21 
 
 		 411 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  46.95 
 
 		 411 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  47.68 
 
 		 407 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  46.21 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  47.58 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  46.21 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  46.62 
 
 		 381 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  45.96 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  47.65 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.42 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  44.7 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  44.7 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  44.67 
 
 		 433 aa  352  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 435 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  43.78 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  47.34 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  43 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  46.13 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  43.08 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  43.08 
 
 		 391 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  42.82 
 
 		 391 aa  342  9e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  42.09 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 385 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  41.84 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  41.84 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  41.84 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  41.58 
 
 		 385 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  44.07 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  38.92 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.95 
 
 		 394 aa  243  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.95 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.95 
 
 		 394 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  33.16 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 		 367 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  32.63 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 370 aa  196  8.000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  32.99 
 
 		 280 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1761  radical SAM domain protein  33.64 
 
 		 214 aa  152  8.999999999999999e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.6 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  22.28 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 366 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 800 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.54 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  24.27 
 
 		 460 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  22.69 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  28.25 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  31.88 
 
 		 370 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 402 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4133  hypothetical protein  27.31 
 
 		 176 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4012  f165  27.31 
 
 		 176 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  26.74 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4029  f165  27.31 
 
 		 176 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>