297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4206 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  96.11 
 
 
411 aa  833    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  98.78 
 
 
411 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  98.05 
 
 
411 aa  849    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  96.84 
 
 
411 aa  841    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  99.76 
 
 
411 aa  862    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  96.11 
 
 
411 aa  832    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  96.11 
 
 
411 aa  833    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
411 aa  863    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  95.62 
 
 
411 aa  831    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  51.23 
 
 
444 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  48.09 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  48.35 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  48.09 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  48.09 
 
 
431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  48.09 
 
 
431 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  47.61 
 
 
433 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  48.89 
 
 
438 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.58 
 
 
395 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.58 
 
 
396 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.58 
 
 
395 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  47.01 
 
 
435 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  47.01 
 
 
435 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  46.77 
 
 
435 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.33 
 
 
396 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  45.21 
 
 
405 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.58 
 
 
398 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  44.47 
 
 
431 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 
397 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  45.84 
 
 
381 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  45.82 
 
 
407 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  45.08 
 
 
440 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  45.62 
 
 
407 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  45.93 
 
 
414 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  44.9 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.19 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.19 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.19 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  46.19 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  45.94 
 
 
398 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 
414 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  41.71 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  41.71 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  41.71 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  41.33 
 
 
385 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  41.33 
 
 
385 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 
385 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  41.33 
 
 
385 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 
385 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  41.33 
 
 
385 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 
385 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  41.07 
 
 
385 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  40.25 
 
 
391 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  40.25 
 
 
391 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
391 aa  328  7e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 
393 aa  325  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 
410 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 
410 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  36.95 
 
 
394 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  36.69 
 
 
394 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  36.69 
 
 
394 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  33.85 
 
 
383 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  35.92 
 
 
394 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
402 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 
367 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  32.72 
 
 
370 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 
368 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  31.57 
 
 
369 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 
370 aa  202  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  33.22 
 
 
280 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1761  radical SAM domain protein  33.02 
 
 
214 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.2 
 
 
380 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
436 aa  132  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 
383 aa  124  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 
385 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  25.6 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 
389 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
800 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  34.43 
 
 
401 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  27.4 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 
393 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  25.46 
 
 
381 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 
397 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 
414 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 
376 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
397 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 
397 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 
377 aa  103  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  23.94 
 
 
399 aa  102  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  22.92 
 
 
370 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
410 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  21.97 
 
 
391 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  28.34 
 
 
401 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 
453 aa  95.5  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>