More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1520 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  716    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 		 476 aa  149  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  27.7 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 461 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 452 aa  123  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 453 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 460 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  27.62 
 
 		 447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 489 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.96 
 
 		 489 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  28.19 
 
 		 484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.98 
 
 		 450 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 450 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 728 aa  106  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 462 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 492 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 486 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 464 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 453 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.56 
 
 		 477 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 443 aa  97.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  35.05 
 
 		 470 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.8 
 
 		 446 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 485 aa  96.3  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 507 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 510 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  30.24 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 403 aa  93.2  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 476 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 460 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 476 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 430 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.65 
 
 		 432 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 518 aa  91.7  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 365 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 499 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 476 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.61 
 
 		 389 aa  89.4  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 442 aa  89.4  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 384 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 		 464 aa  87.4  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 		 434 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 394 aa  86.7  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  26.18 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0782  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  24.86 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  24.86 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  25.5 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  25.5 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  26.56 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  21.95 
 
 		 486 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  32.19 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  26.76 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  22.87 
 
 		 394 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>