132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4244 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 369 aa  780    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 728 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 456 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 450 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  29.65 
 
 		 464 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.7 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.11 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.22 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.16 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 518 aa  67  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  22.51 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  22.91 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  22.05 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  21.28 
 
 		 467 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 457 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  21.56 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  24.22 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  23.51 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 455 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  21.66 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 507 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.23 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.23 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  28.23 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  22.95 
 
 		 473 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 470 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 389 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  20 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 446 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.42 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 356 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  21.49 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 469 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 368 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 481 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.38 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.03 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  26.95 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 395 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  21.17 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 435 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  23.03 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  26.52 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  30.89 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>