More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0668 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  914    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  46.29 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  46.29 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 486 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.16 
 
 		 450 aa  177  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 477 aa  144  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.65 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  27.02 
 
 		 452 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 510 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.42 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.75 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 484 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 444 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 339 aa  96.3  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 419 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 455 aa  90.5  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  23.2 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1520  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  20.48 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 728 aa  75.9  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.04 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  20.97 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  24.03 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 460 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  23.19 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  21.99 
 
 		 450 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  20.24 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.19 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 450 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  21.52 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 369 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 458 aa  67  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  20.85 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  22.46 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  20.34 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  22.05 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.87 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  26.94 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.59 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>