More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1700 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 372 aa  770    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  62.1 
 
 		 372 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  58.45 
 
 		 380 aa  451  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  54.3 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  52.82 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 		 356 aa  222  9e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 356 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 353 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  32.03 
 
 		 357 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 		 350 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  25.47 
 
 		 395 aa  96.3  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.53 
 
 		 450 aa  86.3  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.22 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  22.55 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.96 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  22.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  22.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  22.79 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.94 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.8 
 
 		 470 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 468 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.96 
 
 		 457 aa  66.2  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.63 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.54 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.37 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.73 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  23.78 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.76 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 510 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  35.19 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.9 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.87 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  21.47 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.87 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  21.25 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.45 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.45 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>