More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0906 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  71.81 
 
 		 447 aa  688    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  100 
 
 		 450 aa  935    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  60.27 
 
 		 461 aa  580  1e-164  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  57.48 
 
 		 489 aa  558  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  53.47 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  54.41 
 
 		 457 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  54.28 
 
 		 450 aa  503  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  53.23 
 
 		 453 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  50.89 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  50.68 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  44.3 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  42.51 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  46.68 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  44.69 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  45.36 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  28.07 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.87 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 476 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 470 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 476 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  29.6 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 		 447 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 486 aa  136  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 462 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 430 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  26.68 
 
 		 728 aa  117  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.54 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 460 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 518 aa  109  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  28.01 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 474 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 400 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 507 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 429 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  23.56 
 
 		 432 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 499 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 368 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 467 aa  93.6  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 365 aa  93.2  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  23.59 
 
 		 457 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  26.88 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27.14 
 
 		 391 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27.14 
 
 		 391 aa  93.2  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  23.54 
 
 		 470 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 453 aa  90.1  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  27.63 
 
 		 275 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  28.1 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 405 aa  87  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 372 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>