268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1401 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  100 
 
 
356 aa  731    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  48.19 
 
 
356 aa  349  4e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 
356 aa  300  2e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 
350 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
380 aa  289  4e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
356 aa  288  9e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 
357 aa  277  2e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 
353 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  38.44 
 
 
367 aa  246  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
372 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  34.22 
 
 
372 aa  222  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 
380 aa  219  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  40.93 
 
 
270 aa  215  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  34.95 
 
 
383 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  26.92 
 
 
395 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
447 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  27.32 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 
462 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  26.63 
 
 
473 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 
453 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
450 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 
471 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.16 
 
 
489 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.58 
 
 
447 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.35 
 
 
455 aa  67.8  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
476 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 
429 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  23.08 
 
 
484 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.38 
 
 
477 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 
460 aa  63.9  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 
510 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
452 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  23.1 
 
 
457 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  23.14 
 
 
491 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 
430 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 
457 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  34.78 
 
 
102 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 
450 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 
370 aa  60.1  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.65 
 
 
460 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  21.9 
 
 
436 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  24.4 
 
 
446 aa  59.7  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  22.13 
 
 
728 aa  59.3  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 
491 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.04 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 
468 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.85 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
344 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 
446 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  21.52 
 
 
449 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 
345 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 
394 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  23.53 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  23.84 
 
 
483 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 
458 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
491 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 
422 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
491 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 
453 aa  57  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 
450 aa  56.6  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  22.97 
 
 
473 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 
486 aa  56.2  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 
486 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 
434 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 
405 aa  56.2  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.89 
 
 
470 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.09 
 
 
370 aa  56.2  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 
446 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  21.75 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 
474 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  22.48 
 
 
462 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
464 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
463 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
325 aa  54.7  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 
485 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  34.09 
 
 
397 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 
442 aa  53.1  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 
442 aa  53.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>