More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1909 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  99.56 
 
 
457 aa  920    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
450 aa  924    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  54.28 
 
 
450 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  55.78 
 
 
461 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  51.37 
 
 
447 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  49.02 
 
 
489 aa  463  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  49.09 
 
 
450 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  48.63 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  47.85 
 
 
453 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  45.75 
 
 
452 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 
476 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  42.83 
 
 
452 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
456 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  40 
 
 
473 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 
458 aa  363  4e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 
489 aa  326  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 
465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  30.02 
 
 
476 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 
476 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  30.25 
 
 
476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  30.04 
 
 
476 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
476 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
463 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  31.3 
 
 
484 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
485 aa  173  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.8 
 
 
477 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 
492 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 
460 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 
439 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  26.54 
 
 
470 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 
447 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 
453 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 
477 aa  136  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.77 
 
 
462 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 
518 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 
464 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
460 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
403 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 
486 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  23.48 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  29.86 
 
 
438 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
463 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
463 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 
400 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
394 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 
365 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 
728 aa  103  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  25.95 
 
 
432 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 
351 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 
459 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 
440 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
434 aa  99.8  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
436 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 
481 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 
467 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 
484 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.82 
 
 
457 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  33.95 
 
 
474 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 
455 aa  90.9  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 
323 aa  90.5  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 
471 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 
464 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  28.84 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.22 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  26.8 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  23.22 
 
 
447 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
450 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
800 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.11 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
431 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
290 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.84 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  23.14 
 
 
473 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 
565 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  29.14 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.09 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  22.05 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  22.89 
 
 
481 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.29 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>