More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3298 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 450 aa  934    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  56.15 
 
 		 452 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  53.47 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  51.23 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  51.79 
 
 		 461 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  50.75 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  48.46 
 
 		 473 aa  472  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  47.96 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  48.67 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  49.09 
 
 		 450 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  47.32 
 
 		 460 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  49.45 
 
 		 456 aa  449  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  46.52 
 
 		 453 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  48.99 
 
 		 452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  46.76 
 
 		 458 aa  405  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  39.96 
 
 		 489 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  30.64 
 
 		 484 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  31.99 
 
 		 470 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 462 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 476 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  27.29 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 476 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  26.81 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  28.17 
 
 		 447 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 476 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 492 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 486 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  30.98 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 476 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  28.69 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 		 462 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 728 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 477 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 430 aa  126  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 440 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  24.94 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 351 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 464 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 434 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 460 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  28.53 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  27.43 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 394 aa  94.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25.94 
 
 		 380 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 510 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0685  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 474 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 446 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.85 
 
 		 367 aa  92.4  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 402 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 459 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 405 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  27.11 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 290 aa  87.4  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4244  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 		 281 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1098  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)-like protein  24.03 
 
 		 275 aa  87  6e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.852177  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.17 
 
 		 450 aa  87  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.54 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0147  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.54 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.54 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.54 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  27.54 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  24.28 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  24.28 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>