279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0350 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0350  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  763    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.763056  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1700  Radical SAM domain protein  62.1 
 
 		 372 aa  495  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.216048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0233  radical SAM domain-containing protein  60.05 
 
 		 380 aa  479  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2880  radical SAM family protein  57.8 
 
 		 383 aa  463  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0349  hypothetical protein  54.96 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.267481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1401  Radical SAM domain protein  36.8 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 		 356 aa  229  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1372  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 		 356 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.618298 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0266  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 357 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0030  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 350 aa  190  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0572  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0383  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 380 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000167403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0093  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.488444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1332  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3828  radical SAM family protein  25.24 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4137  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.93 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  22.08 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 403 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 462 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1334  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.419933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 449 aa  66.2  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.15 
 
 		 333 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 477 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 516 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 460 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  23.58 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  28.01 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4537  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  23.7 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  32.06 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 467 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  23.98 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  21.78 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  22.01 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  25.36 
 
 		 457 aa  53.9  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  31.97 
 
 		 374 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.32 
 
 		 476 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  22.52 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 510 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 		 330 aa  52.8  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 464 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 1005 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.29 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1339  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.06 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 		 476 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  31.29 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  22.22 
 
 		 280 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>