More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2651 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 415 aa  844    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.1 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.38 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.74 
 
 		 561 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 361 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.57 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  22.25 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.98 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 330 aa  92.8  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.14 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.93 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 496 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  23.75 
 
 		 356 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 381 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.97 
 
 		 346 aa  90.1  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.79 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  25.72 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.4 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 		 516 aa  88.2  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 356 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 323 aa  87  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.85 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 330 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 384 aa  87  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.63 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 389 aa  86.7  8e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  26.32 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 333 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.35 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.32 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  28.08 
 
 		 800 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.13 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.52 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 323 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.54 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  26.74 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  23.45 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.15 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  26.25 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  24.34 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4633  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.26 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0510268  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.37 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  23.08 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.12 
 
 		 327 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>