More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0095 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  57.42 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  47.3 
 
 		 323 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  49 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.81 
 
 		 401 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 401 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 401 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 429 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  28.21 
 
 		 391 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 381 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.99 
 
 		 347 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 429 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  30.28 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 		 378 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.75 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  30.24 
 
 		 561 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 349 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 405 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 398 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 418 aa  122  6e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.15 
 
 		 373 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.19 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 		 380 aa  122  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 347 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 496 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 480 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.13 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.83 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 501 aa  117  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.44 
 
 		 397 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.49 
 
 		 479 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  30.18 
 
 		 769 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 405 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.49 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 391 aa  112  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.21 
 
 		 355 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  24.46 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  27.69 
 
 		 491 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 399 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.25 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  28.67 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 377 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  34.56 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  26.16 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  28.12 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 396 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 394 aa  103  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 404 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.86 
 
 		 359 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.75 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1710  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.32 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 393 aa  99.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  32.83 
 
 		 377 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>