More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2942 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  81.46 
 
 		 356 aa  634    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  81.74 
 
 		 356 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  83.43 
 
 		 357 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  81.69 
 
 		 358 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  81.97 
 
 		 358 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 358 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  82.49 
 
 		 354 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  68.48 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  47.23 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  46.06 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  44.25 
 
 		 363 aa  330  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  44.51 
 
 		 359 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  44.51 
 
 		 358 aa  323  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  44.22 
 
 		 377 aa  322  5e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 405 aa  316  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  40.4 
 
 		 414 aa  312  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  40.68 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.52 
 
 		 397 aa  305  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  40.35 
 
 		 561 aa  298  9e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  37.09 
 
 		 413 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  40.87 
 
 		 769 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  38.99 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 		 327 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  35.15 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  36.9 
 
 		 375 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  36.81 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 		 372 aa  228  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  36.01 
 
 		 335 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  36.87 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 381 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  35.73 
 
 		 356 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  32.52 
 
 		 377 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 		 353 aa  215  9.999999999999999e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  32.25 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  32.25 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  31.98 
 
 		 377 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  34.38 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 399 aa  209  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.59 
 
 		 496 aa  207  3e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 		 364 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  35.36 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 444 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 399 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.86 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.71 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 369 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 		 364 aa  185  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 382 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  33.8 
 
 		 359 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.99 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  30.18 
 
 		 342 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.07 
 
 		 399 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.74 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 405 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  31.12 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 391 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.97 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.75 
 
 		 399 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 501 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 394 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.09 
 
 		 422 aa  162  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 407 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.68 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>