More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1018 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  88.78 
 
 
396 aa  718    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  83.03 
 
 
391 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  100 
 
 
401 aa  823    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
401 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
401 aa  823    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  88.24 
 
 
395 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  75.19 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  75.06 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  69.78 
 
 
410 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  68.95 
 
 
409 aa  569  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  73.2 
 
 
405 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  74.79 
 
 
412 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  60.12 
 
 
367 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  40.54 
 
 
337 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 
347 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  45.1 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.12 
 
 
479 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
429 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  31.88 
 
 
349 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.01 
 
 
346 aa  156  6e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 
496 aa  153  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
398 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.23 
 
 
332 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 
325 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 
327 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.66 
 
 
380 aa  149  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 
399 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
391 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 
380 aa  145  9e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 
428 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 
363 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.71 
 
 
397 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 
316 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
359 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 
414 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
330 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 
358 aa  143  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 
358 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.2 
 
 
378 aa  142  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  32.19 
 
 
565 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 
389 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
389 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 
377 aa  139  7e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
334 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  32.07 
 
 
405 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.13 
 
 
373 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.61 
 
 
356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
384 aa  135  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 
356 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
357 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0609  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
384 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
480 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  32.75 
 
 
394 aa  134  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
358 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 
381 aa  132  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  30.22 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 
333 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  30.92 
 
 
769 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 
377 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 
399 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  31.83 
 
 
491 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.61 
 
 
375 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
372 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.52 
 
 
422 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 
491 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 
330 aa  123  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
368 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 
501 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  32.37 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 
491 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35.61 
 
 
413 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 
333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  28.93 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 
381 aa  120  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 
399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29 
 
 
335 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  30.66 
 
 
491 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 
386 aa  116  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
390 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  28.74 
 
 
366 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.11 
 
 
397 aa  116  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  28.05 
 
 
377 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 
323 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  27.91 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  27.91 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.97 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 
482 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.789613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>