More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1343 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
334 aa  690    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  68.4 
 
 
330 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  65.95 
 
 
330 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  66.26 
 
 
335 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  67.38 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  61.16 
 
 
332 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  58.59 
 
 
333 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  57.8 
 
 
327 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  56.63 
 
 
333 aa  403  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  48.66 
 
 
349 aa  320  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  43.32 
 
 
414 aa  294  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 
363 aa  291  7e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 
381 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 
377 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  42.15 
 
 
405 aa  288  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  43.2 
 
 
561 aa  286  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 
359 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  42.4 
 
 
349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  40.65 
 
 
346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  41.12 
 
 
399 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  42.36 
 
 
356 aa  275  6e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  42.73 
 
 
769 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.59 
 
 
397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 
325 aa  258  7e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  38.64 
 
 
366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 
358 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  36.69 
 
 
358 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  36.69 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 
354 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 
357 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  37.68 
 
 
479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 
358 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  35.23 
 
 
496 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 
389 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  36.92 
 
 
372 aa  209  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
501 aa  209  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  35.21 
 
 
375 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 
480 aa  206  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  36.29 
 
 
399 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 
377 aa  205  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  39.2 
 
 
398 aa  205  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
347 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 
380 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 
380 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  34.59 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 
380 aa  197  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  30.59 
 
 
378 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  30.59 
 
 
377 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  30.88 
 
 
377 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  30.59 
 
 
377 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 
342 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
418 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 
372 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 
364 aa  189  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 
391 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
389 aa  187  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 
384 aa  186  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 
369 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.64 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  34.94 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
381 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 
367 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  33.63 
 
 
394 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 
409 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 
407 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 
405 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 
394 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.67 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  39.37 
 
 
413 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
368 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.58 
 
 
422 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  34.83 
 
 
355 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 
386 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.69 
 
 
399 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 
399 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 
393 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 
382 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 
375 aa  169  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
394 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.57 
 
 
397 aa  168  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.66 
 
 
394 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 
397 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 
389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 
382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 
378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  33.73 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  32.55 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 
370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 
350 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  28.96 
 
 
342 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 
376 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.23 
 
 
373 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 
395 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.18 
 
 
393 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>