More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2637 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  100 
 
 
350 aa  713    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  57.58 
 
 
378 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  55.62 
 
 
369 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  54.21 
 
 
370 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  54.78 
 
 
368 aa  394  1e-108  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  49.45 
 
 
382 aa  342  7e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  43.14 
 
 
389 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  42.13 
 
 
375 aa  292  5e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 
380 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  39.37 
 
 
367 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  37.39 
 
 
375 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  37.78 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 
353 aa  251  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 
367 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
381 aa  249  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  37.11 
 
 
364 aa  248  8e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 
376 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 
364 aa  245  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 
394 aa  245  9e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  36.54 
 
 
389 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 
444 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.39 
 
 
397 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  35.65 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  35.65 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  35.38 
 
 
377 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  36.22 
 
 
392 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  36.08 
 
 
358 aa  231  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 
359 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  35.1 
 
 
377 aa  230  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 
372 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 
414 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  33.99 
 
 
399 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 
405 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  33.8 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  32.49 
 
 
349 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 
347 aa  219  7.999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 
377 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  32.96 
 
 
561 aa  208  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  34.63 
 
 
342 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  31.06 
 
 
413 aa  205  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
358 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
358 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 
357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 
354 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  32.87 
 
 
356 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
356 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.71 
 
 
479 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
349 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
358 aa  188  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.58 
 
 
769 aa  181  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  32.85 
 
 
327 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.14 
 
 
366 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 
356 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 
330 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 
381 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
382 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 
480 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 
394 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 
397 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.74 
 
 
390 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 
394 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 
399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 
393 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 
501 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.88 
 
 
418 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.81 
 
 
405 aa  152  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.83 
 
 
399 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
407 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  27.62 
 
 
373 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.85 
 
 
422 aa  149  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 
395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.69 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  28.73 
 
 
373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 
399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 
391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
333 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.99 
 
 
335 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
398 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.67 
 
 
393 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  28.33 
 
 
404 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 
396 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.22 
 
 
397 aa  142  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 
389 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 
380 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.39 
 
 
332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 
393 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
380 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>