More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1256 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  100 
 
 
330 aa  682    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  67.38 
 
 
330 aa  484  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  67.38 
 
 
334 aa  474  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  64.63 
 
 
330 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  65.96 
 
 
332 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  64.31 
 
 
335 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  58.46 
 
 
333 aa  416  9.999999999999999e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  56.13 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  56 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  49.85 
 
 
349 aa  327  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  46.29 
 
 
363 aa  310  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 
414 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 
359 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 
358 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  44.08 
 
 
405 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.57 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  42.86 
 
 
349 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 
377 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  43.64 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  41.89 
 
 
346 aa  285  9e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 
399 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  42.94 
 
 
356 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 
354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  40.47 
 
 
561 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  40.95 
 
 
769 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 
358 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 
357 aa  261  8e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
358 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  38.17 
 
 
356 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  37.87 
 
 
356 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  38.55 
 
 
479 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 
358 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  38.01 
 
 
366 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 
480 aa  226  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 
501 aa  225  9e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 
399 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 
398 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
347 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  35.84 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
389 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
418 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
372 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 
377 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 
380 aa  206  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  33.9 
 
 
375 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  36.81 
 
 
382 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.46 
 
 
409 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
380 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 
369 aa  203  3e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
391 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
496 aa  202  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 
342 aa  202  9e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
380 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  34.22 
 
 
384 aa  197  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  31.73 
 
 
377 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 
394 aa  195  9e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  30.88 
 
 
378 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  30.88 
 
 
377 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  30.88 
 
 
377 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  34.99 
 
 
386 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 
394 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 
378 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 
368 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.39 
 
 
394 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 
394 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 
389 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 
405 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
391 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  32.4 
 
 
381 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 
444 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
353 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 
393 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  33.13 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 
378 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 
333 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  34.41 
 
 
364 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.3 
 
 
399 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  32.87 
 
 
355 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
393 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 
393 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 
350 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 
394 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 
397 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 
364 aa  175  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.62 
 
 
397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.53 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  30.91 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
389 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 
399 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 
396 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 
367 aa  170  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
367 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  38.01 
 
 
413 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 
395 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  29.7 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 
390 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>