More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1984 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  100 
 
 
407 aa  825    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  73.7 
 
 
405 aa  623  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  74.87 
 
 
409 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  52.69 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  46.82 
 
 
390 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  48.09 
 
 
393 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  48.08 
 
 
396 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  47.36 
 
 
395 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  46.35 
 
 
399 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  47.45 
 
 
394 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 
391 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  45.11 
 
 
397 aa  361  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  46.06 
 
 
393 aa  353  4e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.53 
 
 
394 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  43 
 
 
390 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  45.48 
 
 
422 aa  349  6e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  44.22 
 
 
399 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  44.64 
 
 
394 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 
394 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 
397 aa  332  8e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 
393 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  46.05 
 
 
355 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  41.81 
 
 
379 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  41.46 
 
 
402 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.33 
 
 
399 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  38.94 
 
 
404 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 
407 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 
406 aa  275  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  37.77 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 
406 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  36.07 
 
 
410 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 
418 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  41.6 
 
 
387 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  37.95 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  39.39 
 
 
387 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  39.28 
 
 
399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.8 
 
 
387 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 
398 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 
366 aa  247  3e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 
389 aa  244  3e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  36.52 
 
 
387 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 
342 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 
380 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 
377 aa  239  9e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  34.84 
 
 
375 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 
380 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
378 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  34.66 
 
 
373 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 
384 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  38.14 
 
 
479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 
496 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 
330 aa  192  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  32.32 
 
 
561 aa  190  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 
501 aa  190  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 
380 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35.47 
 
 
480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  31.9 
 
 
346 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 
399 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 
358 aa  181  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 
332 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 
334 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 
349 aa  177  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 
359 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
330 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 
414 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  34.1 
 
 
335 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  34.01 
 
 
333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  31.53 
 
 
405 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 
377 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.13 
 
 
397 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  33.25 
 
 
769 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
358 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  31.12 
 
 
356 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 
368 aa  166  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 
325 aa  166  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  31.81 
 
 
370 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 
369 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 
357 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
358 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 
358 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 
372 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
358 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  32.1 
 
 
349 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 
327 aa  160  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
378 aa  160  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.84 
 
 
366 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.71 
 
 
413 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 
354 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 
364 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  33.96 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.41 
 
 
375 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 
350 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 
356 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>