More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2710 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  100 
 
 
413 aa  855    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  48.22 
 
 
346 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  46.56 
 
 
349 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  46.17 
 
 
358 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  43.4 
 
 
377 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  42.75 
 
 
414 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 
399 aa  331  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  41.98 
 
 
359 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 
405 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 
363 aa  327  3e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  41.73 
 
 
561 aa  327  3e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.24 
 
 
397 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  42.17 
 
 
769 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  37.41 
 
 
358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  37.41 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  38.6 
 
 
358 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  38.56 
 
 
356 aa  300  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  38.75 
 
 
354 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
357 aa  299  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  37.91 
 
 
356 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  37.59 
 
 
366 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  37.84 
 
 
372 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  36.27 
 
 
378 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  36.27 
 
 
377 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  36.27 
 
 
377 aa  269  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  35.77 
 
 
377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 
372 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  35.52 
 
 
375 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 
380 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 
349 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.68 
 
 
496 aa  248  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  36 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 
389 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 
347 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  35.95 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 
353 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.67 
 
 
479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  33.7 
 
 
342 aa  226  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 
334 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 
332 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 
378 aa  223  7e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 
386 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  34.92 
 
 
364 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  33.25 
 
 
382 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 
389 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 
392 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  33.93 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 
350 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
368 aa  210  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.06 
 
 
369 aa  209  6e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
367 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  31.23 
 
 
370 aa  206  7e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.83 
 
 
399 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 
330 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  32.75 
 
 
364 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  31.8 
 
 
376 aa  202  7e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
501 aa  199  7e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 
398 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 
480 aa  190  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
394 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.33 
 
 
394 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.85 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 
380 aa  180  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
367 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.34 
 
 
399 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 
393 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
384 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.63 
 
 
390 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 
391 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 
405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  39.04 
 
 
327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 
397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.31 
 
 
394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  38.77 
 
 
330 aa  173  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.33 
 
 
355 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 
342 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 
381 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 
393 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
377 aa  172  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 
333 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 
393 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 
382 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
394 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 
389 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 
393 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 
394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  35.68 
 
 
356 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  31.98 
 
 
404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 
396 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 
378 aa  162  7e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 
407 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.37 
 
 
397 aa  159  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>