More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 397 aa  832    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  77.08 
 
 		 422 aa  652    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  74.31 
 
 		 399 aa  632  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  64.23 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  64.25 
 
 		 399 aa  541  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  63.41 
 
 		 397 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  63.73 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  63.22 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  63.07 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  62.47 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  64.74 
 
 		 395 aa  525  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  62.97 
 
 		 393 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  54.29 
 
 		 390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  52.14 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  51.89 
 
 		 391 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  51.76 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  51 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  54.34 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  50.25 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  47.36 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  45.11 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  46.5 
 
 		 405 aa  358  6e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  44.86 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  41.99 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  45.53 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.54 
 
 		 399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  42.74 
 
 		 387 aa  295  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  41.34 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  42.28 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 418 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  41.87 
 
 		 410 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  39.83 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  42.3 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  39.83 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  39.55 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  39.23 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  39.65 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  39.69 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.77 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  37.19 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  34.76 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.78 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  36.43 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  33.84 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  34.37 
 
 		 375 aa  232  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.75 
 
 		 479 aa  209  9e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  35.98 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 		 363 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 496 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 		 377 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  33.52 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  32.01 
 
 		 561 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  30.28 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.05 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 480 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.69 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 		 358 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 358 aa  173  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 501 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.9 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 349 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  32.57 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  31.22 
 
 		 375 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.68 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 375 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.77 
 
 		 769 aa  159  7e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  30.68 
 
 		 335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  29.86 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  29.86 
 
 		 377 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  29.86 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>