More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2609 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  100 
 
 
402 aa  833    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  73.88 
 
 
379 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.58 
 
 
399 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  62.27 
 
 
404 aa  525  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  61.03 
 
 
418 aa  500  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  60.67 
 
 
406 aa  494  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  60.67 
 
 
406 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  59.21 
 
 
387 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  59.84 
 
 
387 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  54.36 
 
 
410 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  56.69 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  57.44 
 
 
387 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  54.33 
 
 
404 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  51.01 
 
 
407 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  46.87 
 
 
391 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  44.36 
 
 
396 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  45 
 
 
399 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  45.04 
 
 
394 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  45.33 
 
 
393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  44.66 
 
 
395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  45.58 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  43.5 
 
 
382 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  45 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  40.62 
 
 
390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  42.49 
 
 
405 aa  301  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  42.37 
 
 
375 aa  300  4e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  41.46 
 
 
407 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 
394 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.44 
 
 
394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  42.3 
 
 
397 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 
399 aa  282  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 
393 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  42.62 
 
 
422 aa  281  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
393 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 
397 aa  279  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  37.93 
 
 
373 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 
409 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 
415 aa  255  9e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 
401 aa  243  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  35.73 
 
 
358 aa  242  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 
391 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 
399 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  36.21 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
342 aa  206  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  34.04 
 
 
366 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 
377 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 
380 aa  182  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 
384 aa  180  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 
389 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 
378 aa  178  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 
377 aa  178  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 
380 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 
496 aa  173  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2082  radical SAM family protein  34.27 
 
 
321 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.460163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  31.16 
 
 
561 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.55 
 
 
346 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 
358 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  32.21 
 
 
373 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.22 
 
 
479 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  34.83 
 
 
349 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
363 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.34 
 
 
366 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
325 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  30.56 
 
 
375 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 
358 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 
358 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.12 
 
 
397 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
480 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 
358 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  28.65 
 
 
356 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
501 aa  152  8.999999999999999e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.37 
 
 
349 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27.79 
 
 
354 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 
357 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 
414 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 
356 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 
389 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 
375 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
330 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 
382 aa  144  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 
330 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 
389 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  29.3 
 
 
378 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  29.3 
 
 
377 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 
327 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  29.3 
 
 
377 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  30.97 
 
 
769 aa  142  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  29.16 
 
 
370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
399 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
378 aa  139  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  28.53 
 
 
377 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 
381 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 
350 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 
353 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  29 
 
 
399 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
372 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>