More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0341 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  100 
 
 
358 aa  727    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  43.32 
 
 
375 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  38.52 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 
404 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.73 
 
 
399 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.2 
 
 
387 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  35.73 
 
 
402 aa  242  9e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  35.01 
 
 
387 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  35.08 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  33.33 
 
 
379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  32.44 
 
 
404 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  32.26 
 
 
387 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 
407 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.02 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 
366 aa  212  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 
390 aa  205  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  33.43 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 
390 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 
396 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 
382 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.84 
 
 
394 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 
391 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 
397 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 
399 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 
407 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 
393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 
394 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 
384 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 
380 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
391 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
389 aa  169  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 
377 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
399 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.78 
 
 
399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 
393 aa  166  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 
380 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.22 
 
 
397 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 
398 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.93 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 
325 aa  152  8e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  29.33 
 
 
479 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 
330 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 
409 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 
378 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 
480 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
349 aa  142  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.15 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 
363 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 
358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  26.76 
 
 
356 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 
501 aa  139  7.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 
381 aa  138  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.27 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 
358 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 
358 aa  135  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 
405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 
354 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  27.79 
 
 
769 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 
350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 
357 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.78 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 
358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 
347 aa  129  7.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 
359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 
342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  24.01 
 
 
375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 
368 aa  127  3e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
370 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  23.86 
 
 
561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 
414 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  25.63 
 
 
366 aa  123  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
496 aa  123  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
330 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 
372 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.74 
 
 
335 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
378 aa  119  7e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.8 
 
 
413 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  23.66 
 
 
378 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  23.66 
 
 
377 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
399 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  23.94 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.66 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>