More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
561 aa  1165    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  64.81 
 
 
769 aa  551  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  50.81 
 
 
377 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  52.35 
 
 
358 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  48.01 
 
 
414 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  50.73 
 
 
346 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  50.72 
 
 
359 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  50.58 
 
 
349 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  50 
 
 
363 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  48.29 
 
 
397 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  47.37 
 
 
399 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  42.82 
 
 
358 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  42.53 
 
 
358 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  42.82 
 
 
357 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  42.32 
 
 
366 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  40.99 
 
 
413 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  41.12 
 
 
405 aa  309  8e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  41.79 
 
 
356 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 
358 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 
372 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  43.2 
 
 
334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  40.56 
 
 
378 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  40.33 
 
 
377 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  40.56 
 
 
377 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  40.56 
 
 
377 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  42.94 
 
 
330 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
349 aa  273  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  42.48 
 
 
330 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 
394 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 
325 aa  265  1e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  40.47 
 
 
330 aa  263  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  40.41 
 
 
327 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
333 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 
332 aa  256  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  40.12 
 
 
335 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  38.42 
 
 
372 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  38.74 
 
 
381 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 
380 aa  253  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  36.68 
 
 
347 aa  250  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  38.2 
 
 
375 aa  250  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 
444 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  38.96 
 
 
342 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 
356 aa  240  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  37.76 
 
 
333 aa  239  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 
364 aa  236  6e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 
381 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 
367 aa  231  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 
386 aa  230  4e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.72 
 
 
496 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  34.37 
 
 
479 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 
353 aa  222  9.999999999999999e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 
399 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 
378 aa  220  7e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
389 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 
367 aa  217  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  35.53 
 
 
399 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 
376 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.39 
 
 
391 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
364 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
392 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  33.99 
 
 
390 aa  209  9e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 
350 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 
501 aa  206  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 
368 aa  206  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 
370 aa  204  4e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 
480 aa  203  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
389 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 
369 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 
398 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 
407 aa  189  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  33.05 
 
 
399 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
382 aa  187  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 
394 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
405 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  34.55 
 
 
399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.01 
 
 
397 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 
393 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  34.27 
 
 
422 aa  183  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.48 
 
 
399 aa  183  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.81 
 
 
382 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  33.84 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 
380 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
393 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
391 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
397 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 
380 aa  176  8e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.78 
 
 
377 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  30.77 
 
 
379 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 
389 aa  174  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 
342 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 
378 aa  173  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
404 aa  172  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.76 
 
 
394 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 
395 aa  171  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 
384 aa  168  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  31.25 
 
 
404 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>