More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1573 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  100 
 
 
372 aa  776    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  79.89 
 
 
377 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  79.89 
 
 
377 aa  631  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  79.08 
 
 
378 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  79.08 
 
 
377 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  79.39 
 
 
342 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  54.37 
 
 
375 aa  408  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  48.08 
 
 
372 aa  350  3e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  45.12 
 
 
386 aa  338  9e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  45.71 
 
 
380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  41.55 
 
 
349 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 
399 aa  319  6e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  45.36 
 
 
381 aa  317  2e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  44.71 
 
 
389 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  44.92 
 
 
444 aa  313  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  41.99 
 
 
367 aa  311  7.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 
353 aa  311  9e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  43.25 
 
 
394 aa  308  9e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 
367 aa  306  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 
363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 
392 aa  305  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  41.97 
 
 
359 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  40.77 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 
399 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  40.55 
 
 
414 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  41.18 
 
 
346 aa  298  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
378 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  40.33 
 
 
561 aa  291  2e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.67 
 
 
397 aa  287  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  41.37 
 
 
389 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 
376 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 
377 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  37.59 
 
 
413 aa  275  7e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 
370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 
369 aa  272  7e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 
368 aa  271  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 
358 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  41.23 
 
 
769 aa  268  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  36.44 
 
 
358 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  36.16 
 
 
358 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  37.33 
 
 
366 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
356 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 
357 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  37.09 
 
 
356 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  36.74 
 
 
354 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 
375 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 
358 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 
350 aa  228  9e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 
325 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  36.03 
 
 
496 aa  223  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
349 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 
333 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 
381 aa  209  4e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  35.13 
 
 
327 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.29 
 
 
330 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
333 aa  203  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
330 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
330 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.88 
 
 
479 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 
334 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  31.16 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 
332 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.62 
 
 
501 aa  177  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 
378 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 
384 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32.4 
 
 
480 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.7 
 
 
393 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 
380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 
399 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
395 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.81 
 
 
390 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
418 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  32.31 
 
 
355 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 
397 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 
391 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 
377 aa  152  7e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 
398 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 
389 aa  150  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.94 
 
 
397 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.6 
 
 
394 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.4 
 
 
415 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.4 
 
 
422 aa  149  9e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 
393 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.4 
 
 
399 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.33 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 
396 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
380 aa  145  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
394 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 
393 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
342 aa  144  4e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  28.21 
 
 
373 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 
393 aa  142  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>