More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0941 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
367 aa  750    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  91.18 
 
 
364 aa  684    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  53.8 
 
 
376 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  48.26 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  47.66 
 
 
353 aa  323  4e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 
372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 
444 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  48.83 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  40.17 
 
 
378 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  40.17 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  40.17 
 
 
377 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  47.4 
 
 
394 aa  312  5.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  41.99 
 
 
372 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 
380 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  40.17 
 
 
377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  43.92 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 
399 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  42.43 
 
 
369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  41.89 
 
 
370 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  42.43 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  41.78 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 
389 aa  301  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
382 aa  296  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 
392 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  38.67 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 
381 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  38.97 
 
 
342 aa  276  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  37.01 
 
 
350 aa  249  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.65 
 
 
349 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 
414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 
375 aa  242  9e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.84 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 
405 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 
359 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  35.17 
 
 
346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 
377 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
363 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  32.6 
 
 
358 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 
399 aa  218  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  33.52 
 
 
561 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 
347 aa  209  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.07 
 
 
413 aa  202  9e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  34.1 
 
 
366 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 
349 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 
358 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 
357 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 
358 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 
496 aa  186  4e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.17 
 
 
358 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.02 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.95 
 
 
769 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  34.99 
 
 
325 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 
356 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
356 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30 
 
 
381 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.68 
 
 
479 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 
330 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.65 
 
 
335 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 
501 aa  156  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 
480 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.62 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 
330 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.24 
 
 
333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 
333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.29 
 
 
382 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
334 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
332 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 
327 aa  143  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.06 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
394 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
384 aa  133  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 
405 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.22 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.89 
 
 
410 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.9 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 
393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 
402 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 
394 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.47 
 
 
390 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.12 
 
 
394 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.93 
 
 
422 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
415 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
391 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  29.46 
 
 
387 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
418 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  27.17 
 
 
397 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 
393 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  28.65 
 
 
373 aa  119  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.67 
 
 
379 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  27.76 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>