More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4381 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
381 aa  770    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  71.81 
 
 
386 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  53.07 
 
 
444 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  52.38 
 
 
399 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  51.76 
 
 
389 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  50.93 
 
 
392 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  48.11 
 
 
372 aa  330  4e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  49.18 
 
 
364 aa  320  3e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  45.7 
 
 
389 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  44.11 
 
 
375 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  45.36 
 
 
372 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  42.62 
 
 
377 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  50.7 
 
 
367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  42.35 
 
 
378 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  46.28 
 
 
380 aa  312  5.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  42.35 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  42.08 
 
 
377 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  44.99 
 
 
382 aa  310  2e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  48.34 
 
 
353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  42.67 
 
 
368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
394 aa  298  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  41.02 
 
 
369 aa  296  3e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  42.02 
 
 
378 aa  296  4e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  45.58 
 
 
375 aa  290  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 
370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  42.63 
 
 
364 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  43.46 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  40.44 
 
 
414 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  39.55 
 
 
349 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 
367 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  39.64 
 
 
342 aa  273  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 
359 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.78 
 
 
397 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 
405 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 
358 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 
377 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  38.44 
 
 
346 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 
399 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 
350 aa  249  8e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  35.54 
 
 
358 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
358 aa  242  7e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  35.18 
 
 
356 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  34.9 
 
 
356 aa  239  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  36.64 
 
 
561 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 
357 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35.44 
 
 
413 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
358 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  36.01 
 
 
366 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 
347 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 
327 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.72 
 
 
769 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  31.68 
 
 
479 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 
330 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
381 aa  185  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
333 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
334 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
496 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 
330 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 
332 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 
333 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.51 
 
 
399 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 
349 aa  171  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.68 
 
 
335 aa  169  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.4 
 
 
390 aa  163  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 
394 aa  162  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 
480 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 
418 aa  159  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 
393 aa  159  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.35 
 
 
397 aa  159  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 
393 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 
382 aa  157  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.68 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 
384 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.52 
 
 
394 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
389 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
380 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 
407 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 
398 aa  151  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 
377 aa  150  3e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.93 
 
 
379 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 
391 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.17 
 
 
422 aa  149  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 
405 aa  149  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 
395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
380 aa  147  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 
394 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.72 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 
393 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 
501 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 
378 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 
397 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  32.33 
 
 
404 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.05 
 
 
415 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
342 aa  142  8e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>