More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0690 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  100 
 
 
496 aa  1029    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  44.52 
 
 
479 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  44.94 
 
 
501 aa  377  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  39.58 
 
 
480 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  39.67 
 
 
346 aa  265  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.29 
 
 
397 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  33.59 
 
 
413 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  36.29 
 
 
359 aa  237  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 
399 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 
414 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 
377 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.53 
 
 
769 aa  229  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  34.72 
 
 
561 aa  229  8e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 
349 aa  229  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  38.71 
 
 
378 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  34.15 
 
 
375 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  36.93 
 
 
363 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  34.57 
 
 
405 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.93 
 
 
349 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  36.46 
 
 
393 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
380 aa  225  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  36.03 
 
 
372 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.56 
 
 
394 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  36.67 
 
 
394 aa  222  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 
330 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 
382 aa  218  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
342 aa  217  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  33.7 
 
 
366 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  32.24 
 
 
377 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  32.24 
 
 
378 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  32.51 
 
 
377 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  32.24 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
394 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 
334 aa  213  7e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 
330 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.33 
 
 
356 aa  211  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 
380 aa  211  3e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 
418 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  36.83 
 
 
377 aa  209  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  32.96 
 
 
390 aa  209  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  34.81 
 
 
381 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 
393 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  35.62 
 
 
384 aa  209  1e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  33.05 
 
 
356 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  32.59 
 
 
358 aa  207  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  34.54 
 
 
333 aa  206  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
398 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 
347 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  34.63 
 
 
397 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  36.56 
 
 
389 aa  205  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 
356 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 
354 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 
332 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 
358 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 
358 aa  203  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.6 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  32.7 
 
 
373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  35.34 
 
 
399 aa  200  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  33.25 
 
 
410 aa  199  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.39 
 
 
335 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 
372 aa  196  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  35.81 
 
 
355 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 
391 aa  195  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 
394 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
330 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 
325 aa  194  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 
407 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 
364 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.71 
 
 
373 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.88 
 
 
391 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  34.05 
 
 
397 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
415 aa  190  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 
333 aa  189  9e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
353 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 
395 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  33.15 
 
 
422 aa  187  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
367 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
364 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 
378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.15 
 
 
379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 
350 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 
393 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 
404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 
390 aa  183  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 
405 aa  183  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
367 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  30.43 
 
 
359 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
381 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  30.98 
 
 
342 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 
389 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 
382 aa  180  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
369 aa  180  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  29.58 
 
 
332 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 
429 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  34.16 
 
 
409 aa  179  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>