More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1706 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 380 aa  778    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  85.11 
 
 		 377 aa  667    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  87.6 
 
 		 380 aa  693    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  85.37 
 
 		 389 aa  671    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  67.72 
 
 		 384 aa  571  1.0000000000000001e-162  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  59.52 
 
 		 378 aa  483  1e-135  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 		 391 aa  255  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 		 399 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  40.47 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  37.31 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  37.56 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.05 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  40.57 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  37.24 
 
 		 422 aa  239  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  39.08 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  39.37 
 
 		 396 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  39.06 
 
 		 394 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  38.56 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  33.84 
 
 		 397 aa  232  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  38.4 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  39.76 
 
 		 327 aa  229  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  38.86 
 
 		 405 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.73 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  37.37 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  39.3 
 
 		 496 aa  225  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.04 
 
 		 479 aa  223  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 501 aa  219  5e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  40.99 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  38.51 
 
 		 355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 480 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  36.23 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  37.8 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  34.1 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  36.34 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.28 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  36.31 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  35.84 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  35.21 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  35.29 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.65 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  34.63 
 
 		 387 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  33.52 
 
 		 379 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  34.99 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  35.21 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  34.1 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  34.81 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  35.78 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.61 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 356 aa  179  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  34.2 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  32.6 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  34.16 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.17 
 
 		 410 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  33.91 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.18 
 
 		 397 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  34.21 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 428 aa  169  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  32.01 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.2 
 
 		 769 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  36.49 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  31.7 
 
 		 389 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 369 aa  158  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.12 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  30.81 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  31.09 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.39 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  30.81 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 356 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>