More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0955 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 391 aa  808    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  68.37 
 
 		 399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  55.01 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  45.64 
 
 		 390 aa  328  8e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  40.86 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 		 394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  41.51 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  42.35 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  38.77 
 
 		 397 aa  272  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  39.32 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  39.67 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  41.85 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  38.58 
 
 		 397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.11 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.25 
 
 		 394 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  39.37 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  41.9 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  38.52 
 
 		 422 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  39.6 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 404 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  40.47 
 
 		 387 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 396 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 		 406 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  39.66 
 
 		 379 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 377 aa  249  4e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  40.47 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  37.4 
 
 		 410 aa  245  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 380 aa  242  7e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 		 402 aa  239  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  39.66 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  38.29 
 
 		 355 aa  236  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 384 aa  233  6e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  38.32 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  38.92 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  35.06 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  34.35 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  37.78 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.09 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  35.39 
 
 		 561 aa  220  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  35.23 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  34.76 
 
 		 358 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  37.22 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  36.08 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  34.66 
 
 		 359 aa  206  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 357 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.47 
 
 		 769 aa  204  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  35.06 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.33 
 
 		 397 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 501 aa  202  6e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 496 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  36.41 
 
 		 401 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  33.85 
 
 		 373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  34.28 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 333 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 		 334 aa  186  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 347 aa  177  4e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  34.29 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.53 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  35.49 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  31.64 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  30.26 
 
 		 444 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  40.67 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>