More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2244 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  83.82 
 
 
377 aa  662    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
380 aa  778    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  87.6 
 
 
380 aa  693    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  83.55 
 
 
389 aa  665    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  65.88 
 
 
384 aa  556  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  59.21 
 
 
378 aa  474  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 
398 aa  276  6e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 
399 aa  259  7e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 
391 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  39.43 
 
 
382 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  39.12 
 
 
390 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 
342 aa  246  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.21 
 
 
391 aa  241  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  40 
 
 
399 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.4 
 
 
394 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  37.85 
 
 
422 aa  238  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 
396 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
393 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  39.28 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  35.37 
 
 
397 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  37.44 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  37.28 
 
 
397 aa  233  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 
393 aa  233  6e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  39.43 
 
 
407 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 
394 aa  229  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 
327 aa  229  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  37.73 
 
 
405 aa  229  5e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  37.73 
 
 
395 aa  229  6e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  37.82 
 
 
393 aa  223  3e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 
394 aa  222  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  37.37 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  34.64 
 
 
479 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.18 
 
 
409 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  38.79 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  38.71 
 
 
480 aa  216  7e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 
496 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 
330 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 
349 aa  206  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 
407 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
366 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.39 
 
 
349 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  36.36 
 
 
387 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 
334 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.96 
 
 
399 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 
333 aa  196  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  35.51 
 
 
404 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  33.33 
 
 
379 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
330 aa  192  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  33.52 
 
 
346 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  36.68 
 
 
387 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
332 aa  190  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 
404 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 
377 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  35.12 
 
 
335 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  34.9 
 
 
381 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 
414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
325 aa  182  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 
402 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  34.47 
 
 
373 aa  179  7e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 
333 aa  179  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 
418 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.83 
 
 
401 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  34.02 
 
 
418 aa  178  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
363 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  32.85 
 
 
387 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  36.73 
 
 
561 aa  177  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 
387 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 
359 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.2 
 
 
397 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.17 
 
 
410 aa  170  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
356 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  32.26 
 
 
332 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 
375 aa  168  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  31.79 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 
429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.11 
 
 
769 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  31.16 
 
 
375 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.53 
 
 
356 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 
347 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 
356 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
358 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
358 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  34.24 
 
 
368 aa  159  7e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 
428 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35.14 
 
 
413 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
358 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 
389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
369 aa  153  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>