More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0612 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  100 
 
 		 387 aa  785    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  96.64 
 
 		 387 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  54.47 
 
 		 404 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  55.56 
 
 		 410 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  57.44 
 
 		 402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  54.57 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  55.73 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  53.3 
 
 		 379 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  55.73 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  55.12 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  55.09 
 
 		 418 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  55.35 
 
 		 387 aa  421  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  50.66 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  47.4 
 
 		 407 aa  338  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  41.78 
 
 		 399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 		 396 aa  301  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 382 aa  299  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  40.74 
 
 		 373 aa  295  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  39.74 
 
 		 375 aa  291  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  41.13 
 
 		 391 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  39.83 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  42.62 
 
 		 422 aa  287  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  41.85 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.55 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  41.88 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 		 394 aa  278  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  38.31 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  40.68 
 
 		 393 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  37.92 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  38.89 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  39.79 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 		 405 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 407 aa  248  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  40.9 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  40.47 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.75 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  39.12 
 
 		 398 aa  228  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  35.36 
 
 		 401 aa  222  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.19 
 
 		 342 aa  203  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 366 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 384 aa  185  9e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 380 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 377 aa  176  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  34.47 
 
 		 479 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 496 aa  167  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  30.03 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  31.73 
 
 		 349 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 349 aa  155  8e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 480 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2082  radical SAM family protein  34.27 
 
 		 321 aa  153  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.460163 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  28.45 
 
 		 561 aa  153  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  32.78 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.05 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 501 aa  145  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  31.12 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.95 
 
 		 335 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 358 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  30.25 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 330 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.02 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 333 aa  136  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 333 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  29.28 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.03 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  29.19 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  28.72 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.83 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.74 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.49 
 
 		 769 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.74 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>