More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1728 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  100 
 
 
380 aa  768    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  65.95 
 
 
372 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  67.96 
 
 
364 aa  490  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  68.6 
 
 
367 aa  487  1e-136  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  48.88 
 
 
394 aa  335  7e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  46.47 
 
 
386 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  45.71 
 
 
372 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  44.77 
 
 
375 aa  325  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  42.98 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  42.98 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  42.98 
 
 
377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  42.78 
 
 
377 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  45.29 
 
 
399 aa  315  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  46.28 
 
 
381 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  43.89 
 
 
367 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  45.15 
 
 
353 aa  308  8e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  43.97 
 
 
444 aa  299  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  43.64 
 
 
389 aa  299  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  43.85 
 
 
369 aa  298  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 
376 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 
378 aa  295  9e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  43.24 
 
 
389 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 
392 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  42.78 
 
 
370 aa  287  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  41.85 
 
 
414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  40.56 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  41.6 
 
 
346 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  41.26 
 
 
359 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  41.39 
 
 
342 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  41.27 
 
 
405 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 
399 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 
377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 
363 aa  272  8.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.72 
 
 
397 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  39.32 
 
 
350 aa  268  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
358 aa  262  6e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  37.68 
 
 
561 aa  253  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
347 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  35.19 
 
 
413 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  39.45 
 
 
375 aa  231  2e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  35.31 
 
 
358 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.57 
 
 
769 aa  228  1e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 
358 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  35.88 
 
 
354 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  36.06 
 
 
366 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 
358 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
325 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 
357 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 
349 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.52 
 
 
356 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  34.99 
 
 
479 aa  212  9e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  34.85 
 
 
356 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 
327 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 
496 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
330 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  35.16 
 
 
335 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
334 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  32.1 
 
 
330 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
333 aa  189  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  35.95 
 
 
405 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
332 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  36.12 
 
 
407 aa  186  6e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
418 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
480 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 
398 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  32.53 
 
 
397 aa  172  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  37.17 
 
 
409 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 
501 aa  171  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  34.01 
 
 
373 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 
397 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.65 
 
 
394 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 
399 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 
393 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 
399 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
395 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.1 
 
 
394 aa  166  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.02 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.53 
 
 
422 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 
396 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 
393 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 
394 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 
393 aa  156  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  29.73 
 
 
399 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32.78 
 
 
391 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 
389 aa  149  9e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 
377 aa  147  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 
393 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
382 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  30.61 
 
 
342 aa  145  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  31.94 
 
 
404 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.49 
 
 
355 aa  143  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>