More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0512 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  717    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.82 
 
 
397 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  39.94 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  39.94 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  39.94 
 
 
377 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  39.11 
 
 
377 aa  285  7e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 
363 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 
399 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 
414 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  38.74 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  39.39 
 
 
375 aa  269  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 
359 aa  268  8e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  36.55 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 
370 aa  258  9e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  37.97 
 
 
346 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 
368 aa  252  7e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  36.68 
 
 
561 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 
377 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 
369 aa  247  2e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 
364 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
378 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 
358 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  38.89 
 
 
342 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  41.4 
 
 
367 aa  241  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 
444 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.18 
 
 
769 aa  234  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  37.72 
 
 
353 aa  232  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 
389 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
349 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 
394 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  35.18 
 
 
386 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  35.96 
 
 
389 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  35.78 
 
 
330 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 
382 aa  219  6e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  38.92 
 
 
350 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 
354 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 
356 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 
381 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 
325 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 
381 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  35.11 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  34.49 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 
357 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  32.76 
 
 
366 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 
330 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 
356 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  36.16 
 
 
392 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 
367 aa  209  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  35.67 
 
 
332 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 
496 aa  205  8e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.43 
 
 
335 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
358 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  35.51 
 
 
479 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
334 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  35.29 
 
 
375 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 
333 aa  202  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.15 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 
501 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 
399 aa  176  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  31.34 
 
 
373 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  32.19 
 
 
480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  35.03 
 
 
391 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.29 
 
 
390 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 
391 aa  169  8e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
415 aa  159  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 
418 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
395 aa  151  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.1 
 
 
355 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 
378 aa  149  7e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 
382 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.23 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
399 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
394 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.57 
 
 
397 aa  146  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 
393 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 
393 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 
390 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 
394 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 
342 aa  142  7e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.97 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  28.53 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.2 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.09 
 
 
380 aa  139  6e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 
404 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.39 
 
 
407 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  29.6 
 
 
357 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  31.18 
 
 
487 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 
418 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>