More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0999 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  100 
 
 
399 aa  799    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  59.13 
 
 
444 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  60 
 
 
389 aa  455  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  59.9 
 
 
392 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  49.62 
 
 
386 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  52.38 
 
 
381 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  43.68 
 
 
375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  45.65 
 
 
372 aa  319  5e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 
372 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  45.29 
 
 
380 aa  315  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  43.04 
 
 
367 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  46.07 
 
 
389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  39.95 
 
 
377 aa  299  7e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  42.78 
 
 
364 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  39.68 
 
 
378 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 
353 aa  297  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  39.68 
 
 
377 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  39.95 
 
 
377 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 
382 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  43.88 
 
 
364 aa  290  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  44.44 
 
 
367 aa  288  8e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  42.51 
 
 
376 aa  286  4e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 
378 aa  278  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 
394 aa  276  5e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  40.55 
 
 
369 aa  275  8e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  41.1 
 
 
368 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  40.55 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  38.42 
 
 
342 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  44.63 
 
 
375 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  36.86 
 
 
349 aa  252  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.4 
 
 
397 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 
350 aa  246  6e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  37.81 
 
 
414 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 
377 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  36.05 
 
 
358 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  37.26 
 
 
359 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  36.29 
 
 
399 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 
405 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  36 
 
 
413 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  36.16 
 
 
363 aa  233  5e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  35.42 
 
 
346 aa  229  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  34.05 
 
 
561 aa  222  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  34.49 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 
354 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 
358 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 
358 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  29.6 
 
 
358 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
357 aa  203  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.98 
 
 
356 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.17 
 
 
366 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.05 
 
 
769 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
356 aa  189  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.58 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 
381 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
349 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.69 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 
330 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
496 aa  166  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
327 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.33 
 
 
335 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.22 
 
 
390 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 
333 aa  153  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 
330 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  28.07 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 
394 aa  144  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 
330 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.33 
 
 
394 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 
501 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 
382 aa  142  9e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.5 
 
 
399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 
384 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.95 
 
 
397 aa  139  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 
399 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29 
 
 
402 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.3 
 
 
355 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.47 
 
 
399 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 
334 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 
397 aa  136  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 
415 aa  136  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
391 aa  135  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  30.3 
 
 
398 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 
393 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.5 
 
 
379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 
406 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30.36 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.22 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  30 
 
 
387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  29.29 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  27.03 
 
 
378 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
393 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 
380 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>