More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 769 aa  1595    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  64.81 
 
 		 561 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  55.04 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  54.71 
 
 		 358 aa  411  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  50.24 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  54.47 
 
 		 405 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  54.02 
 
 		 363 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  55.07 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  51.8 
 
 		 399 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  54.55 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  54.18 
 
 		 397 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  53.04 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 		 357 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 		 356 aa  317  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  41.67 
 
 		 413 aa  316  9e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  42.21 
 
 		 358 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  41.93 
 
 		 358 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  43.19 
 
 		 356 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  42.32 
 
 		 366 aa  313  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 		 354 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 		 358 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  43.7 
 
 		 330 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 		 334 aa  287  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  41.23 
 
 		 372 aa  286  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  41.76 
 
 		 349 aa  282  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  42.82 
 
 		 330 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 		 330 aa  274  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  44.67 
 
 		 325 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  38.42 
 
 		 378 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  38.42 
 
 		 377 aa  273  7e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  38.15 
 
 		 377 aa  273  9e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  38.15 
 
 		 377 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 333 aa  270  8.999999999999999e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  41.69 
 
 		 332 aa  264  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2066  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.63 
 
 		 359 aa  262  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.348008  hitchhiker  0.0096425 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  40.18 
 
 		 335 aa  259  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 327 aa  259  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 		 381 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  37.18 
 
 		 347 aa  253  1e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  36.81 
 
 		 375 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 		 380 aa  248  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 		 372 aa  248  4e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  38.68 
 
 		 479 aa  248  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 		 333 aa  247  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 		 356 aa  246  8e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 		 496 aa  244  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12320  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 385 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 367 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  37.8 
 
 		 342 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  34.79 
 
 		 368 aa  228  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  34.71 
 
 		 378 aa  228  3e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 370 aa  228  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 394 aa  226  9e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 		 364 aa  224  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  37.54 
 
 		 390 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  37.75 
 
 		 353 aa  219  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3349  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.52 
 
 		 337 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  34.43 
 
 		 369 aa  218  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  34.72 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 		 399 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 386 aa  214  5.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 501 aa  213  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 382 aa  213  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 399 aa  210  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 418 aa  210  8e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  34.74 
 
 		 391 aa  209  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  34.86 
 
 		 480 aa  209  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  35.2 
 
 		 389 aa  206  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 376 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  36.08 
 
 		 394 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 364 aa  200  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 		 350 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 367 aa  198  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 392 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  35.56 
 
 		 399 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 389 aa  196  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  33.25 
 
 		 393 aa  195  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 		 405 aa  195  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4037  AsnC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 328 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 391 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0512  AsnC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 341 aa  191  5e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  34.64 
 
 		 382 aa  188  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0074  AsnC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 334 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 398 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.25 
 
 		 407 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  35.84 
 
 		 378 aa  182  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 393 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 395 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.78 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 380 aa  180  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 394 aa  178  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 		 342 aa  178  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 390 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 384 aa  177  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.14 
 
 		 399 aa  177  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 399 aa  177  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 397 aa  177  9e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>