More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0879 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  704    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  51.84 
 
 		 381 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  53.31 
 
 		 356 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  48.95 
 
 		 330 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  48.66 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  45.65 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  44.54 
 
 		 349 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  49.85 
 
 		 330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  48.35 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  46.25 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  44.91 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  46.85 
 
 		 332 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  42.65 
 
 		 346 aa  293  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  44.88 
 
 		 333 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  42.94 
 
 		 358 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  42.21 
 
 		 405 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.32 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  42.41 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  39.83 
 
 		 561 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 		 363 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  41.69 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  41.45 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  41.76 
 
 		 769 aa  270  2.9999999999999997e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  38.4 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  38.97 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 358 aa  262  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 358 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  38.11 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  39.72 
 
 		 479 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 325 aa  249  7e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  39.49 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  39.11 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 347 aa  230  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 		 496 aa  229  5e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  38.14 
 
 		 501 aa  228  1e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 		 380 aa  219  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  39.24 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  34.42 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  37.7 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  32.78 
 
 		 377 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  32.51 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  32.51 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  32.51 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 378 aa  206  6e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 		 418 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 		 378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  38.35 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 405 aa  195  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 353 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  35.86 
 
 		 359 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  34.33 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  31.6 
 
 		 342 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  33.96 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  38.7 
 
 		 413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  35.61 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.73 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  34.11 
 
 		 333 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 389 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  35.34 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  33.06 
 
 		 399 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 397 aa  176  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 393 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  31.59 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  33.99 
 
 		 379 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  34.02 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 394 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.62 
 
 		 399 aa  172  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 390 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>