More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1679 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  100 
 
 
364 aa  733    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  71.03 
 
 
372 aa  508  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  67.96 
 
 
380 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  71.1 
 
 
367 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  44.78 
 
 
378 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  44.75 
 
 
377 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  44.75 
 
 
377 aa  342  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  44.75 
 
 
377 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  50.88 
 
 
394 aa  340  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  48.26 
 
 
367 aa  339  5e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 
372 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  47.14 
 
 
386 aa  338  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  47.84 
 
 
364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  45.48 
 
 
375 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  49.18 
 
 
381 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  47.66 
 
 
353 aa  317  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  43.88 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 
376 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  44.92 
 
 
389 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  44.5 
 
 
444 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  42.6 
 
 
342 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 
414 aa  292  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  43.15 
 
 
349 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  44.3 
 
 
392 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  41.35 
 
 
368 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 
369 aa  285  9e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 
378 aa  278  1e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 
370 aa  277  2e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 
405 aa  275  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
389 aa  275  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  41.11 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  40.82 
 
 
359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 
377 aa  269  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  39.65 
 
 
399 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
358 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 
382 aa  261  1e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.48 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 
363 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  37.11 
 
 
350 aa  256  5e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 
347 aa  252  6e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  41.78 
 
 
375 aa  246  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  36.06 
 
 
561 aa  243  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 
358 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  36.52 
 
 
358 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 
325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  36.23 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  35.65 
 
 
356 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 
349 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  36.8 
 
 
366 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  35.26 
 
 
769 aa  215  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 
358 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.33 
 
 
479 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 
496 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 
334 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
333 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  34.42 
 
 
330 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 
327 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 
333 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.42 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  36.9 
 
 
335 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 
330 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 
356 aa  183  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  34.4 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 
501 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  38.6 
 
 
413 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 
405 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  32.65 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 
407 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 
380 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  29.86 
 
 
395 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 
418 aa  156  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
380 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 
393 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
394 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
389 aa  151  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.21 
 
 
398 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.49 
 
 
394 aa  150  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 
397 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.43 
 
 
397 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  29.1 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 
409 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 
480 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  29.12 
 
 
422 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 
399 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
415 aa  144  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 
384 aa  143  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 
393 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
378 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 
391 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  29.05 
 
 
359 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 
394 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 
391 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  29.64 
 
 
342 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.18 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>