More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1180 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
418 aa  847    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  35.14 
 
 
346 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  33.93 
 
 
349 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 
330 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  34.74 
 
 
330 aa  215  9e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.43 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 
496 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  33.85 
 
 
327 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35.76 
 
 
480 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 
359 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.47 
 
 
397 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 
349 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 
405 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  34.15 
 
 
330 aa  199  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 
356 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 
501 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  32.94 
 
 
561 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  31.74 
 
 
399 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  33.72 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 
333 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 
381 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 
414 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
356 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 
377 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  34.77 
 
 
335 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  33.43 
 
 
769 aa  192  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 
334 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.44 
 
 
332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
354 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 
363 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
384 aa  187  3e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 
357 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 
377 aa  186  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.99 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
380 aa  184  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
358 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.78 
 
 
366 aa  181  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 
389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 
358 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.02 
 
 
380 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
325 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  30.59 
 
 
390 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 
333 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  32.53 
 
 
342 aa  168  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 
353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 
372 aa  166  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  31.92 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 
398 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  32.44 
 
 
382 aa  162  9e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 
369 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 
394 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 
381 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 
347 aa  158  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
372 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 
368 aa  157  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.5 
 
 
332 aa  155  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
399 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  33.64 
 
 
373 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  29.66 
 
 
375 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 
394 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 
395 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 
364 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.61 
 
 
359 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
350 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
393 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 
391 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 
382 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 
399 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
397 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
389 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  32.24 
 
 
370 aa  152  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.97 
 
 
378 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  26.97 
 
 
377 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.97 
 
 
377 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.45 
 
 
422 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 
378 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.84 
 
 
377 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.81 
 
 
393 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.2 
 
 
394 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 
389 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 
393 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  33.43 
 
 
355 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 
394 aa  143  6e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.08 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.51 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 
394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.56 
 
 
391 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 
396 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 
376 aa  139  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 
409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 
395 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 
407 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 
367 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>