More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2577 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  83.47 
 
 		 359 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 397 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  82.92 
 
 		 405 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  80.33 
 
 		 399 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  73.12 
 
 		 414 aa  589  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  70.43 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  54.73 
 
 		 358 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  53.91 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  57.77 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  52.46 
 
 		 349 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  48.29 
 
 		 561 aa  378  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  54.18 
 
 		 769 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  42.11 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  40.94 
 
 		 357 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 		 358 aa  305  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  40.64 
 
 		 354 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  40.41 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 347 aa  291  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  43.99 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  39.15 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  39.15 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  38.67 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  38.87 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  38.87 
 
 		 377 aa  285  8e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  43.57 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  39.71 
 
 		 375 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 353 aa  282  6.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  40.8 
 
 		 372 aa  276  4e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  43.19 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  41.3 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 		 330 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  40.72 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  41.59 
 
 		 334 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  37.27 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 333 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  35.73 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 		 325 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  38.58 
 
 		 342 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 		 444 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  35.17 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 369 aa  249  8e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  37.4 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 370 aa  243  5e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  37.84 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  38.66 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  36.29 
 
 		 496 aa  239  6.999999999999999e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 364 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  35.39 
 
 		 350 aa  236  7e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  35.25 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  46.19 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  34.48 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  31.47 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  33.95 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 480 aa  192  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 398 aa  186  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  30.21 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 501 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 		 384 aa  179  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.95 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.69 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.92 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.15 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 380 aa  173  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 342 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 377 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  32.23 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.56 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  32.2 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 		 394 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.4 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  30.51 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>