More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2079 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  100 
 
 
333 aa  691    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  60.62 
 
 
330 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  60 
 
 
332 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  58.46 
 
 
330 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  57.23 
 
 
333 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  58.46 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  56.46 
 
 
335 aa  405  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  56.63 
 
 
334 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  53.05 
 
 
327 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  44.88 
 
 
349 aa  290  3e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  42.9 
 
 
363 aa  279  5e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 
377 aa  279  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  41.72 
 
 
349 aa  275  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 
359 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  41.42 
 
 
346 aa  269  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  42.01 
 
 
414 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
358 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 
405 aa  262  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 
399 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  40.7 
 
 
381 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  42.05 
 
 
479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.94 
 
 
397 aa  242  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 
325 aa  242  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  37.76 
 
 
561 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 
354 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  36.28 
 
 
358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  39.94 
 
 
769 aa  236  6e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  37.54 
 
 
356 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  37.17 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  35.69 
 
 
366 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  35.99 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
356 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  36.66 
 
 
356 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 
358 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  36.68 
 
 
399 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
372 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  34.38 
 
 
501 aa  198  9e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  35.73 
 
 
390 aa  195  9e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35.23 
 
 
480 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 
389 aa  190  2e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 
342 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 
496 aa  189  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
377 aa  186  7e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  29.94 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  29.94 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  29.94 
 
 
377 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  33.14 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  32.15 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
380 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  29.66 
 
 
377 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 
380 aa  181  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 
372 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  35.84 
 
 
367 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  34.52 
 
 
364 aa  178  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  31.7 
 
 
375 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 
381 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  34.23 
 
 
378 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.29 
 
 
394 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 
393 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  35.55 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 
393 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 
386 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 
397 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 
384 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
394 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 
418 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
393 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 
409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  29.54 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  33.03 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 
394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  39.37 
 
 
413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.05 
 
 
399 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 
391 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 
382 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 
353 aa  160  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 
390 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 
394 aa  159  8e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  34.39 
 
 
405 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.62 
 
 
422 aa  155  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
369 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 
389 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  32.05 
 
 
399 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 
407 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 
333 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  29.59 
 
 
382 aa  149  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 
396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  31.79 
 
 
355 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.56 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 
367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 
429 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  30.14 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  28.44 
 
 
373 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>