More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0051 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  85.37 
 
 
380 aa  671    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  94.43 
 
 
377 aa  743    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  83.55 
 
 
380 aa  665    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
389 aa  801    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  66.58 
 
 
384 aa  551  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  61.11 
 
 
378 aa  491  1e-137  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  40.87 
 
 
398 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  38.85 
 
 
399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  39.85 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
342 aa  253  6e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  40.8 
 
 
391 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 
407 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  42.26 
 
 
327 aa  242  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  38.36 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  37.69 
 
 
422 aa  240  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  39.59 
 
 
393 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 
405 aa  239  6.999999999999999e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  38.11 
 
 
399 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 
382 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  34.78 
 
 
397 aa  238  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.46 
 
 
394 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  39.69 
 
 
393 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  37.95 
 
 
393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 
409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  38.8 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 
396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 
399 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  37.07 
 
 
479 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 
394 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 
393 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  37.37 
 
 
395 aa  230  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  37.47 
 
 
394 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 
330 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
390 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  37.33 
 
 
480 aa  222  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  37.09 
 
 
415 aa  219  3.9999999999999997e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  38.21 
 
 
330 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  38.68 
 
 
366 aa  218  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  36.02 
 
 
501 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 
349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  38.9 
 
 
355 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 
334 aa  210  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  37.12 
 
 
381 aa  206  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
330 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  38.39 
 
 
335 aa  206  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  36.56 
 
 
496 aa  205  9e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  36.93 
 
 
407 aa  205  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 
333 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  37.98 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 
414 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  34.5 
 
 
346 aa  196  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  34.84 
 
 
379 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  35.53 
 
 
404 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 
405 aa  192  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.03 
 
 
399 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  36.47 
 
 
387 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.68 
 
 
349 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  36.8 
 
 
333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  35.13 
 
 
387 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
406 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 
406 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  34.27 
 
 
356 aa  187  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 
377 aa  183  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 
363 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  35.41 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  35.51 
 
 
418 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 
418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 
387 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  34.1 
 
 
373 aa  179  8e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 
402 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  34.81 
 
 
325 aa  178  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  34.29 
 
 
401 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.52 
 
 
387 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  35.96 
 
 
561 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 
375 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.2 
 
 
397 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
358 aa  169  9e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.35 
 
 
410 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.29 
 
 
769 aa  166  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  31.23 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  31.92 
 
 
359 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  34.03 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  30.14 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 
429 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
389 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 
356 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 
358 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  31.1 
 
 
332 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  30.88 
 
 
375 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  29.07 
 
 
354 aa  156  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 
358 aa  156  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 
389 aa  156  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  28.07 
 
 
358 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 
347 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 
333 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>