More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0691 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
333 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  62.88 
 
 
330 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  64.11 
 
 
332 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  63.5 
 
 
330 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  62.27 
 
 
335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  58.59 
 
 
334 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  57.23 
 
 
333 aa  410  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  56.13 
 
 
327 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  56.13 
 
 
330 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  43.82 
 
 
346 aa  309  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  44.91 
 
 
349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  43.19 
 
 
363 aa  295  9e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  42.65 
 
 
349 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  42.24 
 
 
381 aa  291  7e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  41.18 
 
 
358 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 
405 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  42.35 
 
 
359 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 
399 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  40.46 
 
 
414 aa  280  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.71 
 
 
397 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 
325 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  40.52 
 
 
561 aa  260  2e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  39.24 
 
 
366 aa  258  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  41.94 
 
 
769 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  39.6 
 
 
479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  38.04 
 
 
358 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  37.75 
 
 
358 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  37.46 
 
 
356 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  36.66 
 
 
354 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 
356 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 
357 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  33.06 
 
 
377 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  33.06 
 
 
372 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  35.8 
 
 
399 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  32.78 
 
 
378 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  32.78 
 
 
377 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  32.78 
 
 
377 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  37.1 
 
 
390 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  34.54 
 
 
496 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 
347 aa  202  7e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  36.69 
 
 
378 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 
342 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  33.52 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  35.03 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
398 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  35.61 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.31 
 
 
380 aa  194  1e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
501 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 
480 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 
418 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  33.9 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 
372 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 
380 aa  189  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
364 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  33.79 
 
 
386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 
381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 
369 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 
368 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  31.61 
 
 
342 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  34.43 
 
 
367 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.43 
 
 
394 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  34.39 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  40.54 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  34.01 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 
391 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  33.04 
 
 
359 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  31.64 
 
 
353 aa  171  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  31.69 
 
 
376 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 
370 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  31.12 
 
 
393 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 
378 aa  169  6e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  31.65 
 
 
422 aa  169  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 
394 aa  165  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 
394 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  30.28 
 
 
373 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.31 
 
 
397 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  32.09 
 
 
382 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 
333 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 
429 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 
393 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
397 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 
390 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  30.77 
 
 
399 aa  159  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 
394 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 
444 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 
375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 
399 aa  155  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 
428 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 
409 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 
364 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 
389 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>