More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0324 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  100 
 
 
480 aa  985    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  43.15 
 
 
479 aa  350  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  39.58 
 
 
496 aa  348  1e-94  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
501 aa  329  8e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 
342 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 
389 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  37.22 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  36.39 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 
377 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 
330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  38.71 
 
 
380 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 
384 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 
349 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 
380 aa  213  7e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  36.5 
 
 
381 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  33.8 
 
 
390 aa  210  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 
327 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  32.86 
 
 
346 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 
418 aa  206  6e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 
334 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 
332 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  35.21 
 
 
561 aa  204  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
356 aa  203  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
330 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 
398 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  33.81 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 
382 aa  199  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  35.13 
 
 
332 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  34.57 
 
 
769 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 
358 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 
394 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 
391 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 
399 aa  196  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 
389 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  34.83 
 
 
359 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  34.37 
 
 
391 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 
359 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  34.67 
 
 
335 aa  194  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 
333 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  35.23 
 
 
333 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 
414 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.56 
 
 
397 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 
405 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 
399 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  32.11 
 
 
375 aa  187  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 
390 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  32 
 
 
354 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  32.81 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  35.47 
 
 
407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 
405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 
363 aa  184  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 
409 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
368 aa  182  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.33 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
380 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  33.15 
 
 
397 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  35.07 
 
 
369 aa  180  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
357 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
370 aa  179  7e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
333 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.11 
 
 
422 aa  178  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  33.14 
 
 
355 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 
399 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  34.11 
 
 
387 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 
393 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
394 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 
393 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  33.81 
 
 
399 aa  176  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  34.51 
 
 
378 aa  176  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  33.62 
 
 
393 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
415 aa  176  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  30.29 
 
 
366 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 
407 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
356 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 
358 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  32.19 
 
 
347 aa  174  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.49 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 
382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  29.91 
 
 
358 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  31.67 
 
 
410 aa  173  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  32.71 
 
 
404 aa  173  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 
325 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 
395 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  29.14 
 
 
356 aa  171  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
393 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 
428 aa  169  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  32.4 
 
 
372 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  30.17 
 
 
377 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 
366 aa  169  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  29.89 
 
 
378 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  29.89 
 
 
377 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  33.42 
 
 
387 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  31.03 
 
 
373 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  29.61 
 
 
377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 
350 aa  163  6e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 
406 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 
406 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>